25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2110 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  65.48 
 
 
364 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  64.74 
 
 
366 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  67.03 
 
 
367 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  64.46 
 
 
366 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  53.2 
 
 
369 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  49.72 
 
 
383 aa  359  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  50.28 
 
 
367 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  49.58 
 
 
360 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  46.67 
 
 
369 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  47.61 
 
 
361 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  45.83 
 
 
360 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  44.48 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  44.23 
 
 
360 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  40.6 
 
 
363 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  36.26 
 
 
385 aa  202  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  34.51 
 
 
376 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  32.66 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  38.08 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  28.85 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  30.3 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  25.62 
 
 
361 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  26.56 
 
 
426 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  22.29 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>