25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2635 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  738    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  95.28 
 
 		 360 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  71.67 
 
 		 362 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  53.71 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  48.87 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  47.59 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  46.65 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  45.83 
 
 		 365 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  47.58 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  47.04 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  50 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  45.77 
 
 		 383 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  46.52 
 
 		 367 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  45.48 
 
 		 369 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  44.09 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  38.08 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  36.39 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  35.82 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  36.64 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  40.2 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  35.02 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  29.69 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  25.54 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  28.62 
 
 		 426 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>