58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3295 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  100 
 
 		 365 aa  759    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  44.64 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  43.87 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  44.21 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  44.96 
 
 		 373 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  43.25 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  43.45 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.95 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  43.66 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  40.84 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  40.4 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  41.98 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  41.45 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  47.7 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  42.69 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  47.06 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  44.63 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  44.63 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  45.25 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  46.38 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  44.63 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  45.95 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  44.51 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.14 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  31.09 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  34.88 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.72 
 
 		 606 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  30.77 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  30.53 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.72 
 
 		 606 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.1 
 
 		 1061 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.33 
 
 		 821 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  29.47 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  31.52 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  30.53 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  30.85 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.77 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  29.01 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  22.69 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.17 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  31.4 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 618 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  32.35 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  27.91 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  28.72 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  35.9 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  37.33 
 
 		 840 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  28.7 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  33.01 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  29.55 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  24.49 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  29.41 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  33.98 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  33.98 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>