50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2307 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  66.01 
 
 
309 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  61.64 
 
 
305 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  60.33 
 
 
305 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  61.11 
 
 
312 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  58.2 
 
 
311 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  64.67 
 
 
303 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  58.84 
 
 
311 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  57.01 
 
 
314 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  57.01 
 
 
314 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  56.69 
 
 
314 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  60.52 
 
 
311 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  60.52 
 
 
311 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  60.86 
 
 
306 aa  364  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  60.19 
 
 
311 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  59.55 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  56.48 
 
 
325 aa  349  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  55.08 
 
 
306 aa  348  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  56.44 
 
 
304 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  53.29 
 
 
320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  51.49 
 
 
306 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  54.21 
 
 
302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  52.82 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  54.27 
 
 
309 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  51.18 
 
 
301 aa  322  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  44.76 
 
 
362 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  60 
 
 
190 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  44.9 
 
 
115 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  27.71 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  27.71 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  35.79 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  43.28 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  43.28 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  43.28 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  43.28 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  36.59 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  30.83 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  36.25 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  41.54 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  27.64 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  39.39 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  29.41 
 
 
340 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  38.46 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  38.46 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  30.53 
 
 
365 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.19 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  35.06 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  28.33 
 
 
340 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  28.45 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.27 
 
 
400 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>