27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1010 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  75 
 
 
305 aa  297  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  75.53 
 
 
305 aa  297  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  71.81 
 
 
306 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  70.05 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  67.89 
 
 
311 aa  268  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  65.61 
 
 
304 aa  268  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  67.89 
 
 
311 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  67.72 
 
 
311 aa  264  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  67.72 
 
 
311 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  67.72 
 
 
311 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  66.67 
 
 
314 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  66.67 
 
 
314 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  66.15 
 
 
314 aa  260  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  66.14 
 
 
311 aa  257  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  68.95 
 
 
303 aa  251  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  61.5 
 
 
309 aa  247  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  61.83 
 
 
302 aa  247  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  62.03 
 
 
306 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  60.75 
 
 
306 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  60 
 
 
306 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  56.93 
 
 
320 aa  237  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  59.14 
 
 
301 aa  233  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  54.76 
 
 
362 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  59.14 
 
 
325 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  54.26 
 
 
306 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  54.59 
 
 
309 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>