43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1347 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  634    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  65.25 
 
 		 305 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  64.92 
 
 		 305 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  64.72 
 
 		 311 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  63.96 
 
 		 311 aa  411  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  63.78 
 
 		 314 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  63.78 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  64.03 
 
 		 312 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  65.32 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  63.04 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  62.18 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  61.9 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  61.59 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  62.78 
 
 		 311 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  63.02 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  63.02 
 
 		 311 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  62.14 
 
 		 311 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  60.26 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  63.79 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  57.62 
 
 		 306 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  55.08 
 
 		 306 aa  348  7e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  57.24 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  57.58 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  49.71 
 
 		 362 aa  334  9e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  52.96 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  48.84 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  71.81 
 
 		 190 aa  281  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  59.18 
 
 		 115 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  21.76 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  30.95 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  30.95 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  30.95 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  29.76 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  30.95 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  29.33 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.12 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  25.78 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  29.63 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>