42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2121 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  99.68 
 
 		 311 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  98.39 
 
 		 311 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  94.53 
 
 		 311 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  86.41 
 
 		 311 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  85.26 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  85.26 
 
 		 314 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  85.58 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  84.74 
 
 		 311 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  65.35 
 
 		 305 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  63.11 
 
 		 305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  63.02 
 
 		 306 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  62.9 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  61.18 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  60.52 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  64.03 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  58.2 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  56.17 
 
 		 306 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  58.31 
 
 		 325 aa  358  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  57.43 
 
 		 302 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  54.46 
 
 		 301 aa  341  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  55.48 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  54.36 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  54.37 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  51.95 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  46.86 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  67.72 
 
 		 190 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  54.37 
 
 		 115 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  29.27 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  28.85 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  24.56 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  24.56 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  26.92 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  26.92 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  27.88 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  27.88 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  27.88 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  27.88 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  26.92 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.29 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>