48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0302 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  71.62 
 
 		 305 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  69.31 
 
 		 305 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  64.03 
 
 		 306 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  61.29 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  62.14 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  61.11 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  63.55 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  61.28 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  60.06 
 
 		 314 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  59.29 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  62.9 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  62.9 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  58.68 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  62.9 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  59.42 
 
 		 314 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  58.42 
 
 		 306 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  62.58 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  58.56 
 
 		 309 aa  359  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  59.6 
 
 		 302 aa  359  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  57.28 
 
 		 325 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  58.61 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  55 
 
 		 301 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  50.85 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  55.23 
 
 		 306 aa  328  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  52.81 
 
 		 309 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  70.05 
 
 		 190 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  61.22 
 
 		 115 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  31.16 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  28.44 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  28.44 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  30.28 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  30.28 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  32.93 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  32.93 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  32.93 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  32.93 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  30.97 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  26.83 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.12 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.74 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  28.74 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  29.55 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  37.88 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.36 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  31.58 
 
 		 345 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.16 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>