47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3555 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  66.67 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  65.56 
 
 		 275 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  65.56 
 
 		 275 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  64.42 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  65.19 
 
 		 275 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  64.81 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  64.07 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  65.19 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  64.07 
 
 		 275 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  64.07 
 
 		 275 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  64.07 
 
 		 275 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  30.97 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  28.14 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  30.16 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  28.32 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  31.73 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  41.54 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  33.33 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  28.41 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  32.14 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  29.2 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  30.95 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  34.15 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  31.25 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  36.47 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  26.09 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  36.92 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  24.39 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  29.76 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  28.85 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  32.5 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  28.85 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  28.21 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2062  hypothetical protein  27.15 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.41 
 
 		 599 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.33 
 
 		 585 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.47 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  38.57 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  35.9 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  21.36 
 
 		 484 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.22 
 
 		 506 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>