65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2401 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 306 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  71.47 
 
 		 320 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  72.05 
 
 		 304 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  67.32 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  65.54 
 
 		 301 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  62.62 
 
 		 305 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  61.76 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  61.97 
 
 		 305 aa  407  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  63.04 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  61.03 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  52.84 
 
 		 362 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  60.94 
 
 		 302 aa  374  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  58.42 
 
 		 312 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  55.48 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  56.58 
 
 		 311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  55.7 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  55.7 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  55.05 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  56.17 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  56.17 
 
 		 311 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  56.17 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  56.17 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  59.6 
 
 		 303 aa  345  7e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  55.12 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  51.49 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  50.33 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  62.03 
 
 		 190 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  59.18 
 
 		 115 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  27.66 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  31.73 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  27.38 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.7 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  35.44 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  25.93 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.72 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3296  hypothetical protein  27.22 
 
 		 602 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  29.82 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.5 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  27.5 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.83 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  28.72 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.3 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.95 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.18 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.21 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.96 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.53 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.2 
 
 		 354 aa  42.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  30.53 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.36 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>