68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1461 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 325 aa  678    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  67.32 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  67.22 
 
 		 304 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  66.56 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  65.88 
 
 		 301 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  61.2 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  60.2 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  58.5 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  61.46 
 
 		 302 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  58.67 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  60.26 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  52.6 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  57.74 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  58.22 
 
 		 311 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  56.55 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  57.28 
 
 		 312 aa  353  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  56.15 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  56.48 
 
 		 306 aa  349  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  55.52 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  58.31 
 
 		 311 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  58.31 
 
 		 311 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  57.98 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  57.33 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  58.78 
 
 		 303 aa  328  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  53.82 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  50.83 
 
 		 309 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  59.14 
 
 		 190 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  50.48 
 
 		 115 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  34.15 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  38.46 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.66 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  30.67 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.65 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.58 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.21 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  31 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.08 
 
 		 337 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.81 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  27.74 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  26.23 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.27 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  26.23 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  28.16 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  29.41 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.38 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  33 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.12 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.38 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  23.18 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>