25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1285 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  78.53 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  68.12 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  68.12 
 
 		 344 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.28 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  65.87 
 
 		 340 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  61.95 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  54.55 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  55.06 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  51.79 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  50.16 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  40.4 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  41.52 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  42.9 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  42.6 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  42.01 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  42.01 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  42.09 
 
 		 342 aa  245  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  42.09 
 
 		 341 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  42.09 
 
 		 346 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  41.79 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  44.44 
 
 		 340 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.88 
 
 		 889 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  28.16 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.994054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>