75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1549 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  631  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  70.55 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  72.05 
 
 
306 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  67.22 
 
 
325 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  64.78 
 
 
301 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  65.99 
 
 
305 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  65.66 
 
 
305 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  65.32 
 
 
306 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  63.33 
 
 
302 aa  391  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  62.25 
 
 
306 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  54.76 
 
 
362 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  60.6 
 
 
311 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  61.28 
 
 
312 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  60.33 
 
 
314 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  59.61 
 
 
314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  60 
 
 
309 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  60.07 
 
 
311 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  59.02 
 
 
314 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  61.18 
 
 
311 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  61.18 
 
 
311 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  61.18 
 
 
311 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  61.18 
 
 
311 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  60.94 
 
 
303 aa  350  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  56.44 
 
 
306 aa  347  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  52.51 
 
 
306 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  65.61 
 
 
190 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  59.38 
 
 
115 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  27.56 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  30.53 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  30.53 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  32.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  29.01 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  32.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  32.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  32.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  27.36 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  28.24 
 
 
275 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  32.93 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.08 
 
 
393 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.36 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3296  hypothetical protein  28.76 
 
 
602 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  29.23 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.97 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.68 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  29.47 
 
 
365 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  28.07 
 
 
342 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.56 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  28.04 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  23.24 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.04 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  30.69 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.37 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.69 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.37 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.69 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.37 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.69 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.69 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.37 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31 
 
 
355 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  27.19 
 
 
342 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.97 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  27.19 
 
 
342 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  26.04 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  27.19 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  27.19 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.79 
 
 
426 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.36 
 
 
349 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.45 
 
 
348 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  26.19 
 
 
342 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>