69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2263 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  631  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  60.86 
 
 
306 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  55.92 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  57.1 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  55.59 
 
 
305 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  55.12 
 
 
306 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  55.23 
 
 
312 aa  345  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  53.82 
 
 
325 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  53.57 
 
 
311 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  53.4 
 
 
311 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  52.88 
 
 
314 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  52.96 
 
 
306 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  51.75 
 
 
320 aa  333  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  52.24 
 
 
314 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  51.92 
 
 
314 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  52.51 
 
 
304 aa  332  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  52.68 
 
 
302 aa  331  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  54.69 
 
 
311 aa  328  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  54.37 
 
 
311 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  54.37 
 
 
311 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  55.33 
 
 
303 aa  325  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  54.05 
 
 
311 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  51.01 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  50.34 
 
 
309 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  50.51 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  43.27 
 
 
362 aa  290  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  54.26 
 
 
190 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  54.35 
 
 
115 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  32.37 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  26.6 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  26.24 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  26.24 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  26.11 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  26.11 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  40.3 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  40.3 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  40.3 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  40.3 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  40 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35 
 
 
400 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  34.88 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  39.39 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.29 
 
 
359 aa  49.3  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.36 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.95 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.95 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.95 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.94 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  30.95 
 
 
337 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  31.63 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  33.33 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.92 
 
 
341 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  36.36 
 
 
334 aa  45.8  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  29.9 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  30.93 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.4 
 
 
631 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  30.93 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.96 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  24.63 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.93 
 
 
344 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.29 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.81 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.29 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  39.19 
 
 
360 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>