43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1921 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  98.09 
 
 
314 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  96.82 
 
 
314 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  96.82 
 
 
311 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  90.13 
 
 
311 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  85.26 
 
 
311 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  85.58 
 
 
311 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  85.26 
 
 
311 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  84.94 
 
 
311 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  63.9 
 
 
305 aa  417  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  63.78 
 
 
306 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  63.84 
 
 
305 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  57.28 
 
 
320 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  60.06 
 
 
312 aa  377  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  59.61 
 
 
304 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  57.01 
 
 
306 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  62.34 
 
 
303 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  55.7 
 
 
306 aa  358  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  56.55 
 
 
325 aa  354  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  53.75 
 
 
306 aa  340  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  55.41 
 
 
302 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  52.61 
 
 
301 aa  335  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  53.36 
 
 
309 aa  326  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  47.85 
 
 
362 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  52.24 
 
 
306 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  50.98 
 
 
309 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1010  hypothetical protein  66.67 
 
 
190 aa  261  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1009  hypothetical protein  53.4 
 
 
115 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  30.09 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  29.81 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  29.81 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  36.92 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  27.91 
 
 
274 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.82 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25 
 
 
354 aa  42.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>