42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0908 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  99.64 
 
 
275 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  95.27 
 
 
275 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  95.27 
 
 
275 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  94.18 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  94.18 
 
 
275 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  93.45 
 
 
275 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  69.96 
 
 
274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  66.79 
 
 
274 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  64.07 
 
 
274 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1810  hypothetical protein  30.77 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  43.28 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  33.67 
 
 
303 aa  58.9  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  31.76 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  29.41 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  34.52 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  40.3 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2372  hypothetical protein  30.77 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0310622  normal  0.0664914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2333  hypothetical protein  28.81 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1921  hypothetical protein  36.92 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0586667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  35.38 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1947  hypothetical protein  27.88 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0243684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1954  hypothetical protein  36.92 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0705063  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2374  hypothetical protein  33.75 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  32.31 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1461  zinc carboxypeptidase-related protein  31.71 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02309  Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  36.76 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0981929  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0302  hypothetical protein  32.93 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  27.38 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  33.85 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  33.82 
 
 
305 aa  48.9  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  27.31 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.71 
 
 
599 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2225  hypothetical protein  30.97 
 
 
311 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.21 
 
 
506 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2299  hypothetical protein  27.88 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2197  hypothetical protein  29.03 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.194572  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.29 
 
 
618 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2121  hypothetical protein  27.88 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.347339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>