113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1797 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  62.36 
 
 
615 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
618 aa  1236    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  55.74 
 
 
599 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.91 
 
 
606 aa  811    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.84 
 
 
506 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  67.57 
 
 
606 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  57.09 
 
 
585 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 
541 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.16 
 
 
683 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.74 
 
 
684 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.74 
 
 
683 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.53 
 
 
683 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.07 
 
 
612 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.9 
 
 
631 aa  97.8  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.77 
 
 
619 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.64 
 
 
663 aa  95.9  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.77 
 
 
659 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.7 
 
 
658 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.23 
 
 
627 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.55 
 
 
627 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  22 
 
 
613 aa  87.4  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.27 
 
 
665 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  21.86 
 
 
615 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.86 
 
 
609 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  21.88 
 
 
610 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.86 
 
 
398 aa  77  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.02 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  25.1 
 
 
592 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.15 
 
 
581 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.25 
 
 
581 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  29.37 
 
 
351 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  30.93 
 
 
840 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  21.49 
 
 
576 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.25 
 
 
497 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  34.58 
 
 
490 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  34.62 
 
 
490 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  22.11 
 
 
634 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.9 
 
 
845 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.17 
 
 
361 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  20.61 
 
 
484 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.61 
 
 
422 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  36.54 
 
 
392 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.86 
 
 
393 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  36.36 
 
 
429 aa  58.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.59 
 
 
848 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  26.26 
 
 
885 aa  57.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.94 
 
 
634 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.1 
 
 
384 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.31 
 
 
887 aa  56.2  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  40 
 
 
452 aa  55.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.5 
 
 
526 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.58 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.18 
 
 
355 aa  53.9  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.68 
 
 
852 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  37.14 
 
 
293 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  29.47 
 
 
388 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  29.75 
 
 
242 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  27.56 
 
 
293 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  34.15 
 
 
1247 aa  51.2  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.19 
 
 
911 aa  50.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.78 
 
 
406 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  29.11 
 
 
262 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  29.11 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.4 
 
 
862 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  29.11 
 
 
262 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.11 
 
 
262 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  33.33 
 
 
241 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  29.11 
 
 
262 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.26 
 
 
850 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  29.11 
 
 
262 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  29.11 
 
 
243 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.11 
 
 
400 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  24.54 
 
 
858 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  36.99 
 
 
342 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.23 
 
 
874 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.27 
 
 
382 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  29.63 
 
 
235 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  24.72 
 
 
570 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.91 
 
 
432 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.75 
 
 
821 aa  47.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.19 
 
 
378 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.23 
 
 
382 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  36.99 
 
 
341 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  36.99 
 
 
341 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  35.62 
 
 
342 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  35.62 
 
 
342 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  35.62 
 
 
342 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  36.99 
 
 
346 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  35.62 
 
 
342 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  28.48 
 
 
242 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  30.57 
 
 
249 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.68 
 
 
577 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  30.08 
 
 
256 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.49 
 
 
382 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>