101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3253 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
393 aa  825    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  50.52 
 
 
429 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.03 
 
 
398 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.78 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.44 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  25 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.5 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.7 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  26.18 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.18 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.27 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.63 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.27 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.82 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.97 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  24.27 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.65 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.97 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.61 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.33 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.61 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  23.61 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  23.61 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  23.61 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.61 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.61 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  23.61 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  23.61 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.62 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.05 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  23.34 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  23.34 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  31.97 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.37 
 
 
383 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.02 
 
 
384 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  24.72 
 
 
384 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.29 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.02 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.45 
 
 
374 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.02 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.4 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.4 
 
 
384 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.66 
 
 
375 aa  62.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.03 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.23 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  31.03 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.34 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.87 
 
 
506 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.46 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  25.88 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.59 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.72 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.45 
 
 
606 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  30.77 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.45 
 
 
606 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.72 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  22.68 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  29.46 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.99 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.86 
 
 
618 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.07 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  28.91 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.83 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.04 
 
 
369 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.26 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  23.83 
 
 
375 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.93 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.21 
 
 
375 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.7 
 
 
599 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.77 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  31.31 
 
 
379 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  31.54 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  36.19 
 
 
351 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  27.36 
 
 
305 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  24.68 
 
 
425 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.79 
 
 
889 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  30.08 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.2 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.54 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  30.53 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.56 
 
 
615 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  28.16 
 
 
634 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.7 
 
 
634 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  30.83 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  31.48 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  35 
 
 
500 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.37 
 
 
497 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.76 
 
 
628 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  31.13 
 
 
490 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  28.97 
 
 
459 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  25.42 
 
 
403 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  26.52 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  30.77 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  21.88 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.96 
 
 
821 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  45.28 
 
 
259 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>