53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00674 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  100 
 
 		 592 aa  1212    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.73 
 
 		 581 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  50 
 
 		 581 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.11 
 
 		 581 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.64 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.61 
 
 		 684 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.25 
 
 		 683 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.25 
 
 		 683 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.25 
 
 		 683 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.28 
 
 		 612 aa  339  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  35.47 
 
 		 627 aa  332  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.54 
 
 		 663 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.36 
 
 		 658 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.31 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.88 
 
 		 627 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.36 
 
 		 659 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  35 
 
 		 665 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.22 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.41 
 
 		 631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  34.4 
 
 		 610 aa  310  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.61 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  33.21 
 
 		 615 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.25 
 
 		 634 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  31.9 
 
 		 634 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  28.11 
 
 		 576 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.36 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  27.34 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.06 
 
 		 577 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  27.9 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  24.06 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.2 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.27 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.25 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.85 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.1 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.68 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.71 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 885 aa  57  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.85 
 
 		 829 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  27.32 
 
 		 871 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  23.83 
 
 		 840 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  25.55 
 
 		 823 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.12 
 
 		 862 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.23 
 
 		 860 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.38 
 
 		 923 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.05 
 
 		 834 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.35 
 
 		 887 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.41 
 
 		 911 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.53 
 
 		 852 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  22 
 
 		 983 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.62 
 
 		 850 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  27.7 
 
 		 858 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>