42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  91.32 
 
 
634 aa  1206    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  100 
 
 
634 aa  1310    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  39.94 
 
 
627 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.95 
 
 
659 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.78 
 
 
658 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.61 
 
 
665 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  39.21 
 
 
610 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.92 
 
 
683 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.75 
 
 
684 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.42 
 
 
663 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.41 
 
 
683 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.27 
 
 
612 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.2 
 
 
613 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.41 
 
 
683 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.21 
 
 
627 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  39.34 
 
 
615 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.37 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.56 
 
 
609 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.89 
 
 
631 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
581 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.44 
 
 
581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.87 
 
 
581 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  30.05 
 
 
570 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  31.9 
 
 
592 aa  240  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  28.25 
 
 
576 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.79 
 
 
580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.49 
 
 
580 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.97 
 
 
577 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  25.79 
 
 
575 aa  193  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.65 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  25.86 
 
 
484 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.03 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  20.86 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.8 
 
 
615 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.38 
 
 
606 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.78 
 
 
606 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.96 
 
 
599 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.52 
 
 
618 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.98 
 
 
840 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.16 
 
 
393 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.12 
 
 
422 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.1 
 
 
862 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>