72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4531 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
609 aa  1234    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.49 
 
 
631 aa  601  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.91 
 
 
612 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.29 
 
 
613 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.21 
 
 
619 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.29 
 
 
684 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.12 
 
 
683 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.38 
 
 
627 aa  537  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.29 
 
 
683 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.77 
 
 
658 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.43 
 
 
665 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.77 
 
 
659 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.95 
 
 
683 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  47.95 
 
 
627 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.96 
 
 
663 aa  532  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  46.19 
 
 
610 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  47.09 
 
 
615 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.62 
 
 
634 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  37.56 
 
 
634 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.7 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.35 
 
 
581 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.61 
 
 
581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  36.61 
 
 
592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.64 
 
 
580 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  31.23 
 
 
576 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  28.65 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.48 
 
 
580 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  28.12 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.62 
 
 
577 aa  200  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.86 
 
 
526 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  23.76 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.99 
 
 
606 aa  92.8  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.41 
 
 
606 aa  90.9  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.39 
 
 
615 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.19 
 
 
618 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.69 
 
 
506 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.76 
 
 
599 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.72 
 
 
585 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.6 
 
 
557 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 
541 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.31 
 
 
361 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  29.56 
 
 
840 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 
497 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30.77 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.93 
 
 
376 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.2 
 
 
393 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.3 
 
 
375 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.46 
 
 
422 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.35 
 
 
848 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  25 
 
 
885 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.99 
 
 
375 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.99 
 
 
375 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
375 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.04 
 
 
374 aa  47.4  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  28.22 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.08 
 
 
1034 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.61 
 
 
375 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.3 
 
 
375 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.22 
 
 
375 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.63 
 
 
559 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.3 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.77 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.84 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.99 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.25 
 
 
398 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.66 
 
 
381 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.38 
 
 
375 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.76 
 
 
381 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.38 
 
 
375 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.33 
 
 
378 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 
375 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.1 
 
 
850 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>