57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1110 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  45.86 
 
 		 836 aa  736    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 862 aa  1745    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  39.81 
 
 		 885 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.76 
 
 		 852 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  40.34 
 
 		 871 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  36.43 
 
 		 858 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 863 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.91 
 
 		 848 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.8 
 
 		 848 aa  539  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.36 
 
 		 845 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.02 
 
 		 831 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.33 
 
 		 850 aa  499  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.16 
 
 		 834 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.02 
 
 		 837 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  31.28 
 
 		 816 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.26 
 
 		 860 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 		 829 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  29.16 
 
 		 823 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.2 
 
 		 887 aa  351  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.06 
 
 		 911 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1057 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  28.78 
 
 		 840 aa  171  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  24.49 
 
 		 906 aa  148  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.56 
 
 		 874 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.3 
 
 		 923 aa  114  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  23.82 
 
 		 983 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  29.94 
 
 		 932 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.1 
 
 		 942 aa  94.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  26.56 
 
 		 931 aa  87.8  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.48 
 
 		 910 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.09 
 
 		 923 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.72 
 
 		 526 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.83 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.89 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.11 
 
 		 581 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.77 
 
 		 581 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.01 
 
 		 606 aa  56.2  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.01 
 
 		 606 aa  55.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.54 
 
 		 580 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  23.86 
 
 		 576 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.86 
 
 		 577 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  27.12 
 
 		 592 aa  51.2  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.44 
 
 		 618 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.05 
 
 		 659 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.05 
 
 		 658 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.15 
 
 		 684 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.36 
 
 		 612 aa  48.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.64 
 
 		 683 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.2 
 
 		 665 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.64 
 
 		 683 aa  47.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.64 
 
 		 683 aa  47.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  22.33 
 
 		 575 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.37 
 
 		 506 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 627 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  31.36 
 
 		 627 aa  45.8  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.36 
 
 		 663 aa  45.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  24.1 
 
 		 634 aa  44.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>