42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2083 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 634 aa  1307    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  91.32 
 
 		 634 aa  1206    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.95 
 
 		 659 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  40.78 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.6 
 
 		 658 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.43 
 
 		 665 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.49 
 
 		 684 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.43 
 
 		 683 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  40.66 
 
 		 615 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.16 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.16 
 
 		 683 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  40.61 
 
 		 610 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.97 
 
 		 627 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.84 
 
 		 613 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.75 
 
 		 663 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.86 
 
 		 612 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.58 
 
 		 619 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.62 
 
 		 609 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.02 
 
 		 631 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.91 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.39 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  29.88 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.93 
 
 		 581 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  32.25 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  28.42 
 
 		 576 aa  236  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.88 
 
 		 580 aa  227  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.72 
 
 		 580 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.2 
 
 		 577 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  26.32 
 
 		 575 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.22 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  24.4 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.03 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  20.73 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.37 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.65 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.38 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.17 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.94 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.7 
 
 		 393 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.92 
 
 		 840 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.53 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.76 
 
 		 585 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>