40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2612 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  100 
 
 
575 aa  1186    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  51.99 
 
 
570 aa  610  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.81 
 
 
577 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  47.99 
 
 
576 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.3 
 
 
580 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  39.26 
 
 
484 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.5 
 
 
665 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.19 
 
 
658 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.56 
 
 
631 aa  239  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.6 
 
 
683 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.75 
 
 
612 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.75 
 
 
684 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  28.24 
 
 
627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.04 
 
 
659 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.24 
 
 
683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.24 
 
 
683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.06 
 
 
663 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.16 
 
 
613 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.19 
 
 
627 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.12 
 
 
609 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.66 
 
 
619 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  26.62 
 
 
610 aa  210  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.32 
 
 
634 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  26.62 
 
 
615 aa  207  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  27.61 
 
 
592 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.34 
 
 
581 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.84 
 
 
581 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  25.79 
 
 
634 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.83 
 
 
580 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.65 
 
 
581 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.22 
 
 
526 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.22 
 
 
840 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.33 
 
 
606 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  19.58 
 
 
606 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  25 
 
 
823 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.53 
 
 
599 aa  50.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.32 
 
 
615 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  17.61 
 
 
541 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.33 
 
 
862 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.04 
 
 
837 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>