43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5924 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.57 
 
 		 860 aa  846    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  44.92 
 
 		 823 aa  733    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.94 
 
 		 834 aa  806    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 837 aa  1732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  47.13 
 
 		 816 aa  788    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.31 
 
 		 829 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 862 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.06 
 
 		 863 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.68 
 
 		 911 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.55 
 
 		 852 aa  379  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.11 
 
 		 887 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  31.37 
 
 		 836 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.9 
 
 		 845 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.7 
 
 		 848 aa  343  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.25 
 
 		 885 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.83 
 
 		 848 aa  340  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  28.01 
 
 		 858 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.74 
 
 		 850 aa  336  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 871 aa  327  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.8 
 
 		 831 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1057 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.8 
 
 		 840 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.04 
 
 		 923 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.81 
 
 		 910 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  27.11 
 
 		 932 aa  95.1  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.92 
 
 		 874 aa  94.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  25.6 
 
 		 983 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.21 
 
 		 942 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  24.36 
 
 		 906 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.23 
 
 		 923 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  26.67 
 
 		 931 aa  75.1  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.17 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.37 
 
 		 889 aa  54.3  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  29.58 
 
 		 388 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  26.06 
 
 		 1247 aa  51.6  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.13 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  25.43 
 
 		 351 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  24 
 
 		 659 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.5 
 
 		 627 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.5 
 
 		 658 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  32.79 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  24.02 
 
 		 575 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  23 
 
 		 665 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>