31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  100 
 
 		 425 aa  870    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02290  hypothetical protein  61.45 
 
 		 261 aa  325  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.11 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  25.96 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  23.22 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  24.21 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.26 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  40.23 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  31.21 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.36 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.33 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  20.54 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.2 
 
 		 557 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.81 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  42.86 
 
 		 840 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.96 
 
 		 863 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.68 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3658  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.97 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.03 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.07 
 
 		 848 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.79 
 
 		 837 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.78 
 
 		 848 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.64 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.99 
 
 		 606 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  27.47 
 
 		 816 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  30.69 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.87 
 
 		 559 aa  43.9  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.5 
 
 		 874 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>