34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10433 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  802    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.8 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  45.92 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  33.54 
 
 		 490 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  29.33 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  31.21 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.01 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.93 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.71 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.47 
 
 		 618 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.05 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.5 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.58 
 
 		 837 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.66 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 840 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.72 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.72 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.43 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.71 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.56 
 
 		 599 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.98 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.28 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 541 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.66 
 
 		 365 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  27.84 
 
 		 514 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.89 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.95 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.77 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  32.84 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  28.05 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.44 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.78 
 
 		 382 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>