37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2535 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
860 aa  1777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.69 
 
 
834 aa  772    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.26 
 
 
837 aa  819    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  42.96 
 
 
816 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.79 
 
 
829 aa  853    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  43.47 
 
 
823 aa  717    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
862 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.77 
 
 
852 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.67 
 
 
863 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.69 
 
 
911 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.2 
 
 
887 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  30.33 
 
 
836 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  28.27 
 
 
858 aa  366  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  28.1 
 
 
885 aa  360  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.93 
 
 
848 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.46 
 
 
850 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.74 
 
 
845 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.61 
 
 
848 aa  348  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  28.54 
 
 
871 aa  346  8.999999999999999e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.73 
 
 
831 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  29.9 
 
 
1057 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  30.77 
 
 
840 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.91 
 
 
923 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  23.88 
 
 
983 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.3 
 
 
874 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  27.39 
 
 
931 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.74 
 
 
923 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.2 
 
 
910 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  26.99 
 
 
932 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.39 
 
 
942 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  23.7 
 
 
906 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  24.23 
 
 
592 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  21.57 
 
 
379 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.3 
 
 
580 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.06 
 
 
559 aa  45.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.13 
 
 
581 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.13 
 
 
581 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>