43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4011 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  60.12 
 
 		 848 aa  1038    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 850 aa  1749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.6 
 
 		 852 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  60.54 
 
 		 848 aa  1063    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  60.62 
 
 		 845 aa  1028    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.46 
 
 		 831 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  39.56 
 
 		 858 aa  618  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  38.84 
 
 		 885 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  33.78 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.33 
 
 		 862 aa  492  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  32.21 
 
 		 871 aa  479  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.24 
 
 		 863 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.63 
 
 		 860 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.76 
 
 		 834 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.5 
 
 		 837 aa  337  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  27.04 
 
 		 823 aa  327  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  26.3 
 
 		 816 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.94 
 
 		 829 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.57 
 
 		 911 aa  240  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1057 aa  231  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.46 
 
 		 887 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  24.8 
 
 		 840 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.53 
 
 		 874 aa  101  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  22.34 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  27.2 
 
 		 931 aa  77.8  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  26.32 
 
 		 932 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  28.52 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.58 
 
 		 923 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.83 
 
 		 910 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.12 
 
 		 942 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  25.31 
 
 		 983 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.59 
 
 		 606 aa  55.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.59 
 
 		 606 aa  54.7  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.58 
 
 		 581 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  29.84 
 
 		 452 aa  52  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.47 
 
 		 581 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.23 
 
 		 631 aa  51.2  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.12 
 
 		 581 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.26 
 
 		 618 aa  50.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.81 
 
 		 526 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.25 
 
 		 506 aa  48.5  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.26 
 
 		 580 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 557 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>