49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01020 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  100 
 
 
823 aa  1708    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.01 
 
 
860 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.4 
 
 
834 aa  725    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.16 
 
 
837 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  43.77 
 
 
816 aa  717    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.53 
 
 
829 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.48 
 
 
852 aa  389  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.07 
 
 
911 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.01 
 
 
887 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  29.78 
 
 
885 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.91 
 
 
863 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.19 
 
 
862 aa  364  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  30.42 
 
 
836 aa  360  7e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.93 
 
 
845 aa  354  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  30.04 
 
 
858 aa  350  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.93 
 
 
848 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.77 
 
 
848 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 
850 aa  321  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  27.91 
 
 
871 aa  321  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.06 
 
 
831 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.64 
 
 
1057 aa  258  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  27.64 
 
 
840 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  26.6 
 
 
906 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  22.95 
 
 
983 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  21.94 
 
 
923 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.43 
 
 
874 aa  78.2  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  24.29 
 
 
932 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.42 
 
 
910 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.09 
 
 
942 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  24.03 
 
 
931 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.95 
 
 
923 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.06 
 
 
631 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.75 
 
 
619 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.96 
 
 
580 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  25 
 
 
575 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  25.55 
 
 
592 aa  51.2  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  23.49 
 
 
379 aa  50.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.81 
 
 
659 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.81 
 
 
665 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.07 
 
 
526 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.81 
 
 
658 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.58 
 
 
627 aa  48.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.15 
 
 
577 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  25.81 
 
 
627 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
541 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.81 
 
 
663 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.22 
 
 
1247 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  26.92 
 
 
615 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.12 
 
 
612 aa  45.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>