41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0079 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  43.55 
 
 
823 aa  709    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.15 
 
 
860 aa  722    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.46 
 
 
834 aa  708    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.27 
 
 
837 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  100 
 
 
816 aa  1682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.66 
 
 
829 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.28 
 
 
862 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.74 
 
 
887 aa  353  8e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.19 
 
 
863 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.92 
 
 
845 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.16 
 
 
852 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.37 
 
 
911 aa  337  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  27.31 
 
 
858 aa  337  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  29.11 
 
 
836 aa  333  6e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.86 
 
 
885 aa  333  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.76 
 
 
848 aa  317  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.74 
 
 
848 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.3 
 
 
850 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.96 
 
 
831 aa  299  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  25.71 
 
 
871 aa  283  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  27.93 
 
 
1057 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  32.23 
 
 
840 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.12 
 
 
923 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.31 
 
 
874 aa  95.5  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  23.4 
 
 
983 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  25.84 
 
 
906 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  26.92 
 
 
932 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.33 
 
 
942 aa  78.2  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  23.68 
 
 
931 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.98 
 
 
923 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.86 
 
 
910 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.14 
 
 
580 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.96 
 
 
526 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.77 
 
 
631 aa  50.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  30.93 
 
 
1247 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.36 
 
 
627 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.97 
 
 
563 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.29 
 
 
659 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  27.47 
 
 
425 aa  44.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.04 
 
 
599 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  22.52 
 
 
615 aa  44.3  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>