55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03995 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  43.92 
 
 
836 aa  697    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
885 aa  1836    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.19 
 
 
852 aa  901    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  43.15 
 
 
858 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.44 
 
 
845 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.44 
 
 
848 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.29 
 
 
848 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.81 
 
 
862 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  36.02 
 
 
871 aa  578  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.84 
 
 
850 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.35 
 
 
831 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.25 
 
 
863 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.4 
 
 
834 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  29.82 
 
 
823 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.1 
 
 
860 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  27.86 
 
 
816 aa  333  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.58 
 
 
829 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.84 
 
 
837 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.81 
 
 
911 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.44 
 
 
887 aa  270  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.74 
 
 
1057 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  27.92 
 
 
840 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  22.88 
 
 
923 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  24.91 
 
 
983 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.38 
 
 
874 aa  105  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  24.09 
 
 
906 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  25.83 
 
 
932 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.15 
 
 
923 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 
942 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.5 
 
 
910 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  23.49 
 
 
931 aa  74.7  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.99 
 
 
526 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.47 
 
 
615 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.37 
 
 
606 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.59 
 
 
606 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.26 
 
 
618 aa  58.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  27.27 
 
 
592 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.78 
 
 
506 aa  54.7  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.86 
 
 
581 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.6 
 
 
581 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.45 
 
 
581 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.16 
 
 
580 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.21 
 
 
627 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.54 
 
 
599 aa  50.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.31 
 
 
361 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.14 
 
 
631 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 
609 aa  48.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  23.23 
 
 
452 aa  47.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.5 
 
 
422 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  30.89 
 
 
484 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.63 
 
 
585 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.9 
 
 
557 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  23.71 
 
 
615 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.38 
 
 
577 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.02 
 
 
612 aa  44.3  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>