33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3266 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  100 
 
 		 983 aa  2025    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  36.91 
 
 		 923 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  26.82 
 
 		 906 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.97 
 
 		 874 aa  226  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.63 
 
 		 942 aa  189  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  23.89 
 
 		 932 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.14 
 
 		 923 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.8 
 
 		 910 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  23.36 
 
 		 931 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.83 
 
 		 887 aa  130  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.46 
 
 		 863 aa  118  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.52 
 
 		 911 aa  118  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1057 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.91 
 
 		 885 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 		 860 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.96 
 
 		 862 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.51 
 
 		 834 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  22.68 
 
 		 871 aa  92.8  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.33 
 
 		 837 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  23.4 
 
 		 816 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  24.16 
 
 		 823 aa  84.7  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.93 
 
 		 845 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  22.84 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.2 
 
 		 829 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  25 
 
 		 848 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  24.89 
 
 		 858 aa  74.3  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.95 
 
 		 852 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.31 
 
 		 850 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.98 
 
 		 848 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.74 
 
 		 831 aa  59.7  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  21.71 
 
 		 840 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  21.43 
 
 		 576 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  22 
 
 		 592 aa  44.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>