44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12943 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.86 
 
 		 862 aa  740    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  43.92 
 
 		 885 aa  716    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  100 
 
 		 836 aa  1731    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.4 
 
 		 852 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  40.75 
 
 		 858 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.63 
 
 		 863 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  35.33 
 
 		 871 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.98 
 
 		 848 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.07 
 
 		 845 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.19 
 
 		 848 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.78 
 
 		 850 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 831 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.75 
 
 		 834 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.17 
 
 		 837 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.6 
 
 		 860 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  30.3 
 
 		 823 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  29.11 
 
 		 816 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.67 
 
 		 911 aa  332  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.77 
 
 		 829 aa  326  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 		 887 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1057 aa  251  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.2 
 
 		 840 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  25.2 
 
 		 906 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.55 
 
 		 874 aa  97.4  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  22.84 
 
 		 983 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.09 
 
 		 923 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  29.49 
 
 		 932 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  23.55 
 
 		 931 aa  74.7  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.38 
 
 		 942 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 923 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.46 
 
 		 910 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.62 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.93 
 
 		 631 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.83 
 
 		 606 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.88 
 
 		 506 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.31 
 
 		 606 aa  52.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.17 
 
 		 526 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  23.27 
 
 		 575 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  24.37 
 
 		 592 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.64 
 
 		 581 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.64 
 
 		 581 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.14 
 
 		 581 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.47 
 
 		 618 aa  47.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>