86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1907 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
526 aa  1057    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.55 
 
 
631 aa  223  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  28.2 
 
 
576 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  32.26 
 
 
592 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.63 
 
 
684 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.74 
 
 
612 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.23 
 
 
683 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.4 
 
 
683 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  27.18 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.33 
 
 
658 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.63 
 
 
577 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.72 
 
 
627 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.23 
 
 
683 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.71 
 
 
663 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.34 
 
 
659 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.13 
 
 
665 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.16 
 
 
619 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  27.03 
 
 
570 aa  187  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.76 
 
 
613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  26.68 
 
 
615 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  27.57 
 
 
610 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.86 
 
 
609 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  26.22 
 
 
575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.9 
 
 
580 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.5 
 
 
580 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.22 
 
 
634 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  28.65 
 
 
634 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.57 
 
 
581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.82 
 
 
581 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 
581 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  23.65 
 
 
484 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.18 
 
 
840 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.65 
 
 
837 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  22.48 
 
 
541 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  26.59 
 
 
885 aa  77  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.84 
 
 
862 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  24 
 
 
858 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.56 
 
 
863 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 
834 aa  71.2  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.34 
 
 
848 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.71 
 
 
606 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.71 
 
 
606 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  26.25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.18 
 
 
911 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.25 
 
 
845 aa  67  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  24.3 
 
 
816 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.49 
 
 
615 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.78 
 
 
848 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.58 
 
 
852 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.32 
 
 
618 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  25.78 
 
 
871 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.87 
 
 
599 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  25.85 
 
 
1057 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.02 
 
 
361 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.75 
 
 
829 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.81 
 
 
850 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  22.07 
 
 
823 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  31.17 
 
 
293 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  33.58 
 
 
293 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.36 
 
 
506 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.84 
 
 
831 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.81 
 
 
887 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.17 
 
 
400 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  23.55 
 
 
836 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  29.5 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.07 
 
 
874 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  26.82 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  27.37 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  27.37 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  27.04 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.83 
 
 
585 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  24.69 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  22.73 
 
 
906 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 
497 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  25.13 
 
 
923 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.83 
 
 
406 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.54 
 
 
384 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  29.07 
 
 
384 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  24.42 
 
 
490 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.68 
 
 
384 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  26.67 
 
 
1247 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>