41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0158 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  40.75 
 
 		 858 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 848 aa  1738    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.17 
 
 		 852 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  60.47 
 
 		 850 aa  1039    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.58 
 
 		 848 aa  1224    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.6 
 
 		 831 aa  878    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  58.99 
 
 		 845 aa  1039    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  40.22 
 
 		 885 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  36.04 
 
 		 836 aa  541  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.67 
 
 		 862 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.25 
 
 		 863 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  30.69 
 
 		 871 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.93 
 
 		 860 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.85 
 
 		 829 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.81 
 
 		 837 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.74 
 
 		 834 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  27.59 
 
 		 823 aa  332  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  26.9 
 
 		 816 aa  320  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.06 
 
 		 911 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.72 
 
 		 887 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1057 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.75 
 
 		 840 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  22.87 
 
 		 906 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.28 
 
 		 874 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  26.56 
 
 		 931 aa  84  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  26.84 
 
 		 923 aa  77.4  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  25 
 
 		 932 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  26.07 
 
 		 983 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.17 
 
 		 942 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.61 
 
 		 923 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.56 
 
 		 910 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 526 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  28.24 
 
 		 392 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  24.31 
 
 		 452 aa  49.7  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.68 
 
 		 606 aa  48.9  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.68 
 
 		 606 aa  48.9  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.77 
 
 		 580 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.43 
 
 		 631 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.92 
 
 		 615 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  20.88 
 
 		 541 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  33.78 
 
 		 425 aa  45.8  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>