43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0105 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.19 
 
 		 848 aa  1021    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.89 
 
 		 850 aa  1024    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  61.79 
 
 		 848 aa  1105    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.86 
 
 		 852 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 845 aa  1735    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.68 
 
 		 831 aa  874    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  39.9 
 
 		 858 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  39.44 
 
 		 885 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  35.45 
 
 		 836 aa  535  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.36 
 
 		 862 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 871 aa  475  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.76 
 
 		 863 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  28.81 
 
 		 823 aa  348  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.86 
 
 		 860 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.5 
 
 		 837 aa  343  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  27.92 
 
 		 816 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.49 
 
 		 834 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.7 
 
 		 829 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.91 
 
 		 911 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.85 
 
 		 887 aa  213  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1057 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.64 
 
 		 840 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.83 
 
 		 874 aa  98.6  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  21.46 
 
 		 906 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  25.57 
 
 		 932 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  25.93 
 
 		 983 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.08 
 
 		 942 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  26.11 
 
 		 923 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.71 
 
 		 923 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  24.4 
 
 		 931 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.76 
 
 		 910 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.78 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.78 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.9 
 
 		 618 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.54 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  27.07 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.22 
 
 		 506 aa  51.6  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.35 
 
 		 615 aa  51.2  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.03 
 
 		 559 aa  48.1  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.97 
 
 		 599 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.21 
 
 		 558 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.21 
 
 		 568 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  26.36 
 
 		 392 aa  44.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>