31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7040 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  64.35 
 
 		 932 aa  1250    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 910 aa  1877    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  61.99 
 
 		 923 aa  1197    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  64.5 
 
 		 942 aa  1218    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  45.25 
 
 		 931 aa  776    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  29.49 
 
 		 906 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  25.13 
 
 		 923 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  23.8 
 
 		 983 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.8 
 
 		 874 aa  162  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.3 
 
 		 863 aa  99.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.66 
 
 		 829 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 837 aa  91.3  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  27.86 
 
 		 871 aa  85.5  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.48 
 
 		 862 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  27.55 
 
 		 840 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  24.13 
 
 		 858 aa  80.9  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.2 
 
 		 860 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.5 
 
 		 885 aa  75.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.22 
 
 		 911 aa  75.5  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.98 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.83 
 
 		 850 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.18 
 
 		 852 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.76 
 
 		 845 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  25.86 
 
 		 816 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  25.42 
 
 		 823 aa  67  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  22.75 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.12 
 
 		 887 aa  64.3  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.16 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.56 
 
 		 848 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1057 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.28 
 
 		 831 aa  58.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>