39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0915 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  100 
 
 		 923 aa  1898    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  36.96 
 
 		 983 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  27.97 
 
 		 906 aa  280  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.62 
 
 		 874 aa  259  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  24.76 
 
 		 931 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.03 
 
 		 923 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.82 
 
 		 942 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.24 
 
 		 910 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  30.31 
 
 		 932 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.44 
 
 		 887 aa  140  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.79 
 
 		 911 aa  118  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.16 
 
 		 860 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  22.88 
 
 		 885 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1057 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.97 
 
 		 862 aa  110  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.18 
 
 		 834 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  23.12 
 
 		 816 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.28 
 
 		 837 aa  95.5  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.31 
 
 		 863 aa  94.7  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  28.51 
 
 		 858 aa  88.2  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  28.14 
 
 		 823 aa  85.1  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  23.09 
 
 		 836 aa  81.6  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.11 
 
 		 845 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.19 
 
 		 829 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.31 
 
 		 848 aa  77  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.05 
 
 		 852 aa  75.5  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.58 
 
 		 848 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.52 
 
 		 850 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  20.82 
 
 		 871 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  28.49 
 
 		 840 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.33 
 
 		 831 aa  58.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.04 
 
 		 612 aa  51.6  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 627 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.21 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  23.38 
 
 		 592 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.18 
 
 		 684 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.17 
 
 		 659 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  21.88 
 
 		 627 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.32 
 
 		 658 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>