55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4754 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  65.3 
 
 		 683 aa  919    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  64.42 
 
 		 683 aa  912    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.68 
 
 		 612 aa  969    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  78.81 
 
 		 615 aa  991    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  65.01 
 
 		 683 aa  919    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 627 aa  1296    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.18 
 
 		 663 aa  914    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  70.75 
 
 		 613 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  65.5 
 
 		 684 aa  924    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  69.73 
 
 		 610 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  73.42 
 
 		 659 aa  927    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  69.54 
 
 		 627 aa  912    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.33 
 
 		 658 aa  921    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  65.26 
 
 		 619 aa  841    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  73.45 
 
 		 665 aa  916    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.79 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.38 
 
 		 609 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.97 
 
 		 634 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  39.21 
 
 		 634 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.19 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.83 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 581 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  35.88 
 
 		 592 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.75 
 
 		 580 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.63 
 
 		 577 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.14 
 
 		 580 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  29 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  28.34 
 
 		 570 aa  243  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  29.19 
 
 		 575 aa  230  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.72 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  23.88 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.69 
 
 		 599 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.23 
 
 		 618 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.85 
 
 		 506 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.19 
 
 		 606 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.19 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.04 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.09 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.65 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  23.84 
 
 		 885 aa  53.9  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.49 
 
 		 829 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  23.22 
 
 		 840 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.35 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  25 
 
 		 923 aa  51.2  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  26.58 
 
 		 823 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  25.85 
 
 		 871 aa  47.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  22.63 
 
 		 816 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 862 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.44 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.1 
 
 		 863 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  24.75 
 
 		 858 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.44 
 
 		 568 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.57 
 
 		 497 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.65 
 
 		 834 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.88 
 
 		 837 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>