61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5095 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.98 
 
 		 577 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  100 
 
 		 576 aa  1198    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  50.27 
 
 		 570 aa  597  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  47.99 
 
 		 575 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.94 
 
 		 580 aa  531  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  33.79 
 
 		 484 aa  325  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.98 
 
 		 612 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.69 
 
 		 619 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 631 aa  263  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.61 
 
 		 658 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.87 
 
 		 659 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.26 
 
 		 684 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.26 
 
 		 683 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.33 
 
 		 663 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.52 
 
 		 665 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.9 
 
 		 683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  28.55 
 
 		 615 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  28.87 
 
 		 627 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.08 
 
 		 683 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  28.3 
 
 		 610 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  29 
 
 		 627 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.23 
 
 		 609 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.84 
 
 		 613 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.42 
 
 		 634 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  27.84 
 
 		 592 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  28.25 
 
 		 634 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.46 
 
 		 581 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.39 
 
 		 581 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.72 
 
 		 580 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.74 
 
 		 581 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.07 
 
 		 526 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.73 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.49 
 
 		 618 aa  67  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.29 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.67 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.17 
 
 		 599 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.23 
 
 		 615 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.86 
 
 		 862 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.06 
 
 		 506 aa  51.6  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  30.58 
 
 		 840 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  24.08 
 
 		 906 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.42 
 
 		 384 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  23.74 
 
 		 871 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  23.84 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  21.43 
 
 		 983 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  24.02 
 
 		 858 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.12 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.12 
 
 		 384 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.66 
 
 		 384 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 		 384 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  25.31 
 
 		 384 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  25.31 
 
 		 384 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.12 
 
 		 384 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.38 
 
 		 837 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  24.69 
 
 		 384 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  24.69 
 
 		 384 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  24.69 
 
 		 384 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.66 
 
 		 384 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.66 
 
 		 384 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>