42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2049 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  100 
 
 
484 aa  1004    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  39.26 
 
 
575 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  38.96 
 
 
570 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.65 
 
 
577 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  33.79 
 
 
576 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.57 
 
 
580 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.7 
 
 
612 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.25 
 
 
683 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.86 
 
 
683 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.85 
 
 
613 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.45 
 
 
684 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.95 
 
 
663 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.2 
 
 
665 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.66 
 
 
683 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.6 
 
 
658 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.4 
 
 
659 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.86 
 
 
627 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  25.86 
 
 
634 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.4 
 
 
634 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.21 
 
 
619 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  24.62 
 
 
615 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.88 
 
 
627 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.76 
 
 
609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  24.34 
 
 
610 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.65 
 
 
526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.02 
 
 
631 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  24.06 
 
 
592 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.77 
 
 
581 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.62 
 
 
581 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.97 
 
 
581 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.16 
 
 
580 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.02 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.06 
 
 
599 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  19.6 
 
 
606 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.6 
 
 
606 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.25 
 
 
541 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.88 
 
 
618 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  20 
 
 
506 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.81 
 
 
585 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  30.89 
 
 
885 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.12 
 
 
837 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  21.36 
 
 
274 aa  43.9  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>