51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2901 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 585 aa  1172    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.38 
 
 		 618 aa  591  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.44 
 
 		 606 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.44 
 
 		 606 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.11 
 
 		 615 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.87 
 
 		 599 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.48 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  23.58 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.68 
 
 		 612 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  21.76 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.49 
 
 		 683 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.49 
 
 		 683 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.49 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.49 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.96 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.51 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.17 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.22 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  29.55 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  37.62 
 
 		 293 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  19.31 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.9 
 
 		 613 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.67 
 
 		 355 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.06 
 
 		 659 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.06 
 
 		 658 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.68 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  38.24 
 
 		 293 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  32.11 
 
 		 840 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.06 
 
 		 665 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  26.09 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.38 
 
 		 631 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.87 
 
 		 581 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  26.06 
 
 		 627 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.87 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.91 
 
 		 400 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.17 
 
 		 581 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  27.27 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  20.81 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  41.51 
 
 		 452 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.63 
 
 		 885 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  35 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  31.21 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.47 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  37.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.73 
 
 		 361 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.76 
 
 		 634 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.77 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  22.38 
 
 		 858 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.67 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  41.27 
 
 		 249 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>