69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5441 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1009    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.02 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  42.47 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  42.15 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.67 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  38.24 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  33.23 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.97 
 
 		 615 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.07 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.07 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.54 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.96 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  35.34 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  40.23 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.58 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.16 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.2 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.14 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.67 
 
 		 821 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.06 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.86 
 
 		 557 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 378 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  34.94 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.36 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.32 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.94 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.7 
 
 		 380 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.19 
 
 		 369 aa  47.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.99 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.13 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.99 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.62 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.39 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.99 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  29.84 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.4 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  23.39 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.89 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.97 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.89 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  23.39 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  23.39 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.99 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  23.39 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.89 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  23.39 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  23.39 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.56 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  23.39 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  28.57 
 
 		 840 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  30.7 
 
 		 380 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.56 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.22 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.56 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.93 
 
 		 262 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.92 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  29.03 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.77 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.2 
 
 		 365 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  22.81 
 
 		 384 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.96 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.75 
 
 		 378 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.28 
 
 		 375 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.56 
 
 		 384 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.33 
 
 		 845 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.65 
 
 		 375 aa  43.1  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.17 
 
 		 631 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>