80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3575 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 383 aa  793    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  57.11 
 
 		 379 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.58 
 
 		 375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  56.62 
 
 		 380 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  55.41 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  54.88 
 
 		 374 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.47 
 
 		 375 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  55.97 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.19 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  54.47 
 
 		 375 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  55 
 
 		 375 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.47 
 
 		 375 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.47 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.21 
 
 		 375 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.09 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.21 
 
 		 375 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  55.67 
 
 		 380 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.21 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.95 
 
 		 375 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.21 
 
 		 375 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.09 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.95 
 
 		 375 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  55.88 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.26 
 
 		 381 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.3 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.56 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.44 
 
 		 375 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.89 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.11 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.11 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  52.63 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.63 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  53.52 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.84 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  55.34 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  54.09 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.26 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.7 
 
 		 384 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.7 
 
 		 384 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  52.11 
 
 		 384 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  52.37 
 
 		 384 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.7 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.42 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.42 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.98 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  52.37 
 
 		 384 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.42 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  51.84 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  51.84 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  51.84 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  51.84 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  52.09 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.09 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  51.57 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.4 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  51.1 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.22 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.26 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  48.96 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.96 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.7 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.98 
 
 		 378 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.92 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.84 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  39.66 
 
 		 459 aa  266  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.29 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  25.82 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  22.46 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.37 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.58 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  23.79 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.6 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.95 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.63 
 
 		 559 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  31.94 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  28.26 
 
 		 490 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  28.95 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  28.77 
 
 		 840 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3112  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 568 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>