99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2804 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
384 aa  784    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  50.46 
 
 
351 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  44.8 
 
 
388 aa  288  8e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  35.69 
 
 
490 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  34.67 
 
 
490 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.86 
 
 
497 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  33.14 
 
 
392 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.11 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.21 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  38.26 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.47 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.87 
 
 
369 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.47 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.6 
 
 
506 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  26.03 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  31 
 
 
606 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.69 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  31 
 
 
606 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.18 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  25 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  29.46 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.1 
 
 
618 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.83 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  24.12 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.95 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  23.96 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  32.35 
 
 
840 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  23.96 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  26.79 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.78 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  23.96 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  23.96 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  23.96 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  23.96 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
541 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  23.96 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.15 
 
 
615 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 
424 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.97 
 
 
422 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.15 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.07 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  25 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  34.88 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 
380 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.38 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.38 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.38 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.07 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.22 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
500 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.48 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.07 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.77 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.77 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.59 
 
 
380 aa  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  24.62 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 
375 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 
375 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.12 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.77 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.52 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  24.32 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  31.03 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  36.11 
 
 
1247 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.59 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.94 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  32.91 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.61 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.29 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.32 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  23.39 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.61 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  28.29 
 
 
382 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  25.88 
 
 
375 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.58 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.34 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.12 
 
 
446 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.63 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  28.16 
 
 
1067 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3658  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.38 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.6 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.13 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.08 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.81 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.18 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  24 
 
 
599 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  34.91 
 
 
821 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  25.85 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.09 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  27.05 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  27.27 
 
 
256 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.69 
 
 
388 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  25.17 
 
 
248 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.6 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.91 
 
 
384 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  20.18 
 
 
242 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>