33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2354 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  97.65 
 
 
341 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 
341 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  97.33 
 
 
346 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  90.86 
 
 
342 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  85.55 
 
 
342 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  85.55 
 
 
342 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  85.25 
 
 
342 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  84.37 
 
 
342 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  65.87 
 
 
340 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 
340 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.43 
 
 
344 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  47.06 
 
 
365 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  44.18 
 
 
355 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  44.01 
 
 
344 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  46.43 
 
 
373 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  43.41 
 
 
344 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  43.32 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  43.41 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  42.81 
 
 
343 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  44.66 
 
 
365 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  43.15 
 
 
365 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  42.22 
 
 
356 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.36 
 
 
606 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.36 
 
 
606 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.59 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.99 
 
 
618 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.21 
 
 
218 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.99 
 
 
506 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.1 
 
 
821 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.11 
 
 
1061 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  25.86 
 
 
305 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  29.21 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>