39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1769 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  75.32 
 
 
249 aa  359  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  68.86 
 
 
256 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  68.86 
 
 
256 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  67.97 
 
 
239 aa  321  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  67.11 
 
 
237 aa  321  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  65.69 
 
 
239 aa  320  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  65.94 
 
 
235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  68.12 
 
 
262 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  68.12 
 
 
262 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  69 
 
 
242 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  68.12 
 
 
262 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  68.56 
 
 
242 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  68.12 
 
 
242 aa  318  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  68.12 
 
 
262 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  68.56 
 
 
242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  68.56 
 
 
242 aa  318  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  68.56 
 
 
242 aa  318  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  68.12 
 
 
262 aa  318  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  67.69 
 
 
242 aa  317  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  67.69 
 
 
242 aa  315  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  67.25 
 
 
242 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  58.08 
 
 
236 aa  271  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  57.64 
 
 
248 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.55 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.63 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.59 
 
 
424 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.88 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  31.29 
 
 
514 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.51 
 
 
406 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.11 
 
 
618 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.13 
 
 
379 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.08 
 
 
606 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 
606 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.36 
 
 
506 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.82 
 
 
432 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  29.93 
 
 
437 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.56 
 
 
615 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>