44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0129 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 424 aa  830    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.88 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.2 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  37.57 
 
 		 249 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  34.58 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  33.19 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  32.77 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  32.77 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  32.77 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  32.77 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  35.87 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  35.87 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 242 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 242 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  36.07 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.07 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  36.07 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  32.13 
 
 		 239 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  34.07 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  34.07 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  31.87 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  32.43 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  34.71 
 
 		 237 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  28.29 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  33 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.2 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.08 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  30.91 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.89 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  37.65 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.07 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  26.54 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.29 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  31.47 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.62 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  34.41 
 
 		 821 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  26.83 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.67 
 
 		 889 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  25.88 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  23.49 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>