30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07057 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  100 
 
 		 248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  90.25 
 
 		 236 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  57.21 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  57.64 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  57.21 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  56.14 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  54.01 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  54.01 
 
 		 239 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  56.77 
 
 		 249 aa  262  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  56.09 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  56.09 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 242 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  56.09 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  54.19 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  54.78 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  54.35 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  54.35 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  54.35 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  54.35 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.87 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.67 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.7 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.09 
 
 		 304 aa  72  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  28 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.17 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>